1995年6月，济源市清源水处理有限责任公司成立。

1997年，取得电力系统进网许可证。

1999年，加入中国化学标准化委员会水处理剂分会，成为常务理事单位。

2000年2月，公司通过ISO9001:2000质量体系认证。

2000年3月,新产品“二乙烯三胺五亚甲基膦酸”通过专家组鉴定，达到国际先进水平。

2001年9月,经河南省对外贸易经济合作厅批准，获得进出口经营权。

2002年,年产10000吨三氯化磷生产线投入运行。

2002年,“二乙烯三胺五甲叉膦酸” 产品获得河南省高新技术产品称号。

2003年,公司被评为“市级文明单位”。

2005年初，公司分别被评为济源市2004年度“科技工作先进单位”、“出口创汇先进企业”。

2005年11月,“双1，6-亚己基三胺五亚甲基膦酸的研制” 获得河南省科学技术成果证书。

2005年12月,“双1，6-亚己基三胺五亚甲基膦酸” 产品获得高新技术产品称号。

2006年初,公司分别被评为济源市2005年度“先进企业”、“纳税大户”、“科技工作先进单位”。

2006年3月,成立济源市清源实业有限公司，同月经济源市发展和改革委员会批准30000吨水处理剂项目立项建设。

2006年3月,“双1，6-亚己基三胺五亚甲基膦酸的研制”获得济源市科学技术进步奖。

2006年9月,“羟基亚乙基二膦酸 HEDP”产品获得河南省名牌产品称号。

2006年12月,“双1，6-亚己基三胺五亚甲基膦酸的研制”获得河南省科学技术进步奖。

2007年,公司分别被评为济源市2006年度“安全生产先进集体”、“纳税大户”、“出口工作先进企业”、“科技进步先进单位”。

2007年1月31日,经国家履行禁止化学武器公约工作领导小组办公室批复同意年产3万吨三氯化磷和含磷特定有机化学品生产设施的建设。

2007年5月,年产3万吨水处理剂及3万吨三氯化磷项目建设完成。

2007年10月,公司参与制定的化工行业标准HG/T 2841-2005，“水处理剂 氨基三亚甲基膦酸”标准获得中国石油和化学工业协会科技进步奖。

2007年12月,公司通过ISO14001:2004,GB/T28001-2001认证。

2008年2月,公司分别被评为市级2007年度“工业企业纳税先进单位”、“科技创新先进单位”、“安全管理先进单位”、“工商业固定资产投资先进企业”、“科技进步先进单位”、“外贸进出口先进单位”。

2008年3月,经河南省工商行政管理局批准济源市清源水处理有限责任公司正式更名为河南清水源科技股份有限公司,公司股改完成。同月26日,河南清水源科技股份有限公司正式挂牌成立。

2008年3月27日，公司与南京工业大学签约合作建立实验教学基地。

2008年5月,公司向四川地震灾区捐赠善款47万余元。

2008年6月初,水处理二期扩建工程开工，12月份二期扩建完工，水处理剂产能达到5万吨。

2008年7月31日，公司参与起草的《锅炉用水和冷却水分析方法--磷酸盐的测定》和《水处理剂阻垢性能的测定-碳酸钙沉积法》的中华人民共和国国家标准于2008-04-01发布，于2008-09-01实施。

2009年1月，公司被授予2008河南产品质量管理卓越百强企业。

2009年2月，被评为市”科技进步先进单位”、”十高工业企业”。